Nguyên nhân do số lượng tàu cá cả nước hiện quá nhiều, với hơn 96.600 tàu (trong đó hơn 2.000 tàu lớn có phạm vi hoạt động rộng). Điều này khiến khó kiểm soát phạm vi đánh bắt và dẫn đến hệ quả vẫn còn tình trạng tàu cá Việt Nam đánh bắt trái phép ở vùng biển nước ngoài. Nếu tình trạng này không chấm dứt, thủy sản Việt Nam còn có nguy cơ bị EC nâng thành thẻ đỏ, ảnh hưởng lớn đến thị trường xuất khẩu của thuỷ sản.
Uỷ ban châu Âu (EC) hiện cấm hành vi khai thác hải sản trái phép, không khai báo và khai báo không chính xác. Việt Nam bị rút "thẻ vàng", đồng nghĩa thủy hải sản xuất khẩu sang EU sẽ bị kiểm soát 100% thay vì kiểm tra xác xuất.