5 vấn đề bao gồm: Gắn kết - đồng bộ với quy hoạch kinh tế - xã hội; hạ tầng kinh tế tri thức và công nghệ; chính sách an sinh xã hội; xây dựng khung chính sách thực thi quy hoạch và tương tác trong quá trình lập quy hoạch.
Ngoài ra, UBND TPHCM cũng cho rằng, cần xây dựng khung đánh giá quá trình thực hiện quy hoạch, điều này sẽ giúp các cơ quan chuyên ngành theo dõi, điều chỉnh kịp thời các quy định, quy hoạch đã đặt ra.